アレコリンの分子式はC8H13NO2で、分子量は155.19 g/molです。SMILES記法では「O=C(OC)C=1CN(C)CCC=1」と表記され、1-メチル-1,2,5,6-テトラヒドロピリジン-3-カルボン酸メチルエステルの化学名を持ちます。
参考)https://ja.wikipedia.org/wiki/%E3%82%A2%E3%83%AC%E3%82%B3%E3%83%AA%E3%83%B3
この化合物の構造的特徴として、以下の要素が挙げられます。
物理的性質として、アレコリンは黄色の油状液体で、沸点は209℃、密度は1.0495 g/cm³を示します。この化合物は水、エタノール、メタノール、エーテルに易溶で、クロロホルムにも可溶です。特に水への溶解性が高いことが特徴的で、これが生体内での分布や薬理作用発現に重要な役割を果たします。
参考)https://www.chemicalbook.com/ChemicalProductProperty_JP_CB6930587.htm
アレコリンの三次元構造は、その薬理活性に直接関連する重要な要素です。1,2,5,6-テトラヒドロピリジン環は椅子型配座を取り、N-メチル基は軸方向または赤道方向に配置されます。この立体配置は受容体との結合親和性に大きく影響します。
分子内の官能基配置も重要な構造的特徴です。
CAS番号63-75-2で登録されているアレコリンは、その構造的類似性からニコチンと比較されることが多く、実際に類似した中枢神経系への作用を示します。この構造-活性相関は、アレコリンの薬理学的理解において極めて重要な観点となります。
参考)https://www.kegg.jp/entry/cpd_ja:C10129
アレコリンは遊離塩基として存在するほか、医療や研究分野では塩酸塩や臭化水素酸塩として使用されます。特にアレコリン臭化水素酸塩(CAS番号:300-08-3)は、研究用途で広く用いられています。
参考)https://ja.sh-jiaoze.com/active-pharmaceutical-ingredient/arecoline-hydrobromide-300-08-30
アレコリン臭化水素酸塩の化学式はC8H13NO2・HBrで、以下の特徴があります:
参考)https://www.chemicalbook.com/ChemicalProductProperty_JP_CB1250752.htm
塩形成により、アレコリンの物理化学的性質は大きく変化します。遊離塩基が油状液体であるのに対し、塩は結晶性を示し、取り扱いが容易になります。また、塩酸塩や臭化水素酸塩は潮解性を有するため、保存には注意が必要です。
これらの塩は、アレコリンの窒素原子がプロトン化されて形成されるもので、生理的pH条件下での溶解性や生体利用率の向上に寄与します。
アレコリンの化学構造は、その特異的な受容体結合能力を理解する上で重要な手がかりを提供します。アレコリンは主にムスカリン性アセチルコリンM1、M2、M3受容体の部分作動薬(パーシャルアゴニスト)として作用します。
構造-活性相関の観点から、以下の分子特徴が受容体結合に重要です。
特に、アレコリンとアセチルコリンの構造比較では、両化合物ともに陽性荷電を持つ窒素原子とカルボニル基を有することが共通点として挙げられます。しかし、アレコリンの環状構造は線状のアセチルコリンとは異なる受容体結合様式を示し、これが部分作動薬としての特性の原因となっています。
受容体への結合親和性は、Ki値として定量的に評価され、M1受容体に対して特に高い親和性を示すことが知られています。この選択性は、アレコリンの環状構造と受容体の結合ポケットとの立体的適合性に由来すると考えられています。
現代の分析化学技術により、アレコリンの構造解析はより精密になっています。特に以下の分析手法が構造式の詳細解明に貢献しています。
核磁気共鳴法(NMR)による構造解析
質量分析法による分子量確認
X線結晶構造解析
これらの分析技術により、KEGG DATABASEにおいてもアレコリンは化合物番号C10129として詳細に登録されています。分子量155.0946の精密値や組成式C8H13NO2が確認され、構造式の正確性が保証されています。
さらに、計算化学的手法による構造最適化や分子軌道計算により、アレコリンの電子状態や反応性についても詳細な情報が得られており、これらのデータは新規薬物設計や作用機序解明に活用されています。
現在では、分子動力学シミュレーションによる受容体-リガンド複合体の動的解析も行われており、アレコリンの構造式に基づいた精密な薬理作用予測が可能となっています。